در مرحله يك چهارم نهايي ليگ قهرمانان اروپا 2016-17 مقابل بايرن در آوريل ، رونالدو هر دو گل را در يك برد 2-1 خارج از خانه به ثمر رساند كه باعث شد با تبديل شدن به اولين بازيكني كه به 100 گل در رقابت هاي باشگاهي يوفا رسيد ، تاريخ ساز شود.
[205] در بازي برگشت مرحله يك چهارم نهايي ، رونالدو هت تريك كاملي انجام داد و به صدمين گل خود در ليگ قهرمانان رسيد و اولين بازيكني بود كه اين كار را انجام داد زيرا مادريد پس از وقت اضافي بار ديگر بايرن را 4-2 شكست داد. [206] در 2 مه ، رونالدو هت تريك ديگري كرد و مادريد در بازي رفت مرحله نيمه نهايي ليگ قهرمانان ، اتلتيكو را با نتيجه 3 بر صفر شكست داد. در 17 مه ، رونالدو از جيمي گريوز به عنوان بهترين گلزن تاريخ در پنج ليگ برتر اروپايي پيشي گرفت و دو گل مقابل سلتاويگو به ثمر رساند. [207] او فصل را با 42 گل در همه رقابتها به پايان رساند زيرا به مادريد كمك كرد تا اولين قهرماني خود در لاليگا را از سال 2012 بدست آورد.
[208] در فينال ليگ قهرمانان ، رونالدو در پيروزي 4-1 مقابل يوونتوس دو گل به ثمر رساند و او را به 12 گل در فصل رساند و او را براي پنجمين فصل متوالي (در مجموع ششم) به عنوان بهترين گلزن رقابت ها و همچنين به عنوان بازيكن اول تبديل كرد. گلزني در سه فينال در ليگ قهرمانان ؛ دومين هدف 600 مين دوره حرفه اي او بود. [209] مادريد همچنين به اولين تيمي تبديل شد كه فينال پشت سر هم را در دوران ليگ قهرمانان به دست آورد. [210]